普外科专科医师规范化培训分为初级、中级、高级三个等级，预计培训时间为期四年，其中每一年分为上下半年两个阶段，共8个阶段（S1-S8）：

1、初级专培（第一年S1-S2）：针对大外科临床需求及普外科亚专科常见多发疾病，提供大专科及亚专科核心基础教学课程；

2、中级专培（第二～三年S3-S6）：针对普外科各亚专科急、危、重大疾病，分阶段提供亚专科临床技能教学课程；

3、高级专培（第四年S7-S8）：针对普外科各亚专科和特殊亚专科疑难、复杂疾病，提供各亚专科和特殊亚专科高级临床技能教学课程。

除普外科规范化培训标准课程以外，还可提供“农村与偏远地区外科”选修课程以及通过专培认证后未来可能进一步发展领域的选修课程，如：特殊专项技术技能培训课程。

在普外科专培四年过程中，学员需完成在外科急诊；胃肠外科；结直肠外科；肝胆胰外科及特殊亚专科住院病房；不少于6个月的亚专科轮转及教学大纲中规定的门诊病人数量、急诊病人数量、住院病人数量及规定手术与技术操作数量的管理要求。

在普外科专培四年过程中，学员需完成教学课程中安排的课程测验与阶段考试，成绩合格者方可进入下一阶段学习课程，阶段考试补考仍不合格者将留在原阶段进行重新学习。